宗教の研究をするにはいろいろな大学院が選択肢としてあがります。

例えば、

東京大学大学院人文社会系研究科

東京大学大学院総合文化研究科

東京大学大学院情報学環・学際情報学府

一橋大学大学院社会学研究科

東京工業大学大学院社会理工学研究科

早稲田大学大学院文学研究科

慶應義塾大学大学院社会学研究科

などが東京の近場の大学院ではあります。